传统工控机一般采用便于安装的4U类型标准机箱，机箱采用钢结构，有较高的防磁、防尘、防冲击的能力。机箱内有专用底板，底板上有PCI和ISA插槽。机箱内有专门电源，电源有较强的抗干扰能力 ，具有连续长时间工作的能力。
无风扇嵌入式工控机采用的是全铝面板和嵌入式主板，先进而坚固的机构设计能够承受冲击、振动、湿度和高低温的极限环境。
1.工业级元器件：使用工业级元器件，不但提供卓越的性能，降低了系统内部的发热量，同时也增加了系统的稳定性。
2.特殊的散热：特制散热模块和机构设计为有效的散热提供的保障，加了系统操作温度的上限，也提高了工业级产品的品质和标准。
3.可靠的直流电源输入：系统内置的工业标准电压和电流调节器允许很宽的直流电压输入，在不可知的工业条件下提供安全可靠的操作。
4.电源保护：两种电源保护方式，一种是高压二极管反向输入保护，瞬态电压抑制二极管；另一种是主板上的熔断器。电源保护设计不仅降低了安装失误的风险，而且可以防止系统的意外伤害。
5.静电保护：无风扇嵌入式系统为高速I/O接口内置超低电容ESD保护阵列，如USB、VGA、DVI显示输出等，ESD保护阵列保护系统不受外部ESD威胁，保证电源稳定供应和数据传输。
传统的工控机和无风扇嵌入式工控机的区别，主要可以分为在结构上、在功能上来区别开，传统工控机由于其主板的驱动能力和监容性问题会给实际系统应用带来不便，更会因为缼少主流的接口而给客户带来采购成本的上升。嵌入式主板由于接口更丰富，接口更主流，为客户提供了很大的选则空间，降低成本。